因管理不善丢失货物的是不可以抵扣进项税额的，因为这是一种非正常损失。

根据《中华人民共和国增值税暂行条例》规定，下列项目的进项税额不得从销项税额中抵扣：非正常损失的购进货物，以及相关的劳务和交通运输服务。

因此，因管理不善丢失货物其进项税额不得从销项税额中抵扣，已认证的应按规定做进项转出处理。